Favignana offre soluzioni di soggiorno economiche per chi vuole scoprire l'isola delle Egadi senza spendere una fortuna. Con un budget che parte da circa 80 € a notte, si possono trovare residence, resort e guest house vicino al centro storico e alle spiagge più belle. La maggior parte delle strutture offre camere con angolo cottura o kitchenette, ideali per risparmiare sui pasti fuori. Tra le zone più convenienti ci sono il centro di Favignana, a pochi passi da Piazza Madrice, e le aree vicine a Cala Graziosa e Spiaggia Praia, dove si concentrano molte strutture con parcheggio gratuito e servizio navetta per il porto.
Tra le opzioni più apprezzate spiccano il Residence Favignana, con appartamenti semplici a 200 metri dalla piazza principale, e L'Oasi Villaggio Albergo, un resort eco-sostenibile immerso in un giardino mediterraneo con piscina e vasca idromassaggio. Per chi cerca comfort e tranquillità, il Miramare Residence offre cottage e monolocali in un ampio giardino con accesso gratuito a una spiaggia privata. Il Resort Il Mulino è perfetto per le famiglie, con piscina, ristorante e bar, mentre Plaia Resort propone monolocali e bilocali con cucina attrezzata e piscina all'aperto. Per un soggiorno in pieno centro, Casa Maja Rooms & Suites e Madrice 66 Central Rooms sono guest house moderne con camere climatizzate e balcone, ideali per chi vuole muoversi a piedi e noleggiare una bicicletta per girare l'isola.