Soggiornare in un B&B a Milazzo significa scegliere un alloggio a gestione familiare, spesso in posizioni centrali o sul lungomare. La maggior parte delle strutture si concentra nel centro storico, nei pressi del porto o lungo la Baia del Tono, offrendo colazione continentale o italiana, aria condizionata e WiFi gratuito. I prezzi medi si aggirano tra i 50 e i 100 euro a notte, con possibilità di parcheggio pubblico nelle vicinanze. Per l'alta stagione è consigliabile prenotare con anticipo, specie per le strutture fronte mare.
Tra i B&B più apprezzati spicca Locanda del Bagatto (voto 85, ottimo), che unisce un ristorante romantico a camere climatizzate con vista città. Imperial (voto 84, ottimo) sorge direttamente sulla spiaggia della Baia del Tono, con biciclette a noleggio e ingresso riservato al lido. Castello Di Sotto (voto 100, eccezionale) offre un'esperienza esclusiva in pieno centro. Milazzo Port Rooms (voto 82, ottimo) è ideale per chi arriva in traghetto, con colazione a base di prodotti locali. B&B La Finestra sul Mare (voto 91, eccellente) regala una vista panoramica sul porto e colazione italiana servita in terrazza.