Gli aparthotel di San Teodoro uniscono l'indipendenza di un appartamento con i servizi di una struttura ricettiva. Ogni unità è dotata di cucina o angolo cottura, consentendo di gestire i pasti in autonomia, e spesso include spazi esterni privati come patio o giardino. La maggior parte delle strutture offre parcheggio gratuito e piscina all'aperto, con tariffe che partono da circa 70 € a notte in bassa stagione. Le zone centrali (vicino a Via Mare) e quelle a ridosso delle spiagge (La Cinta, Porto Taverna) sono le più richieste per chi cerca spiaggia e servizi a portata di mano.
Tra le strutture meglio valutate spiccano Residence Il Melograno (voto 93/100, a 1,2 km da La Cinta Beach), con cucina attrezzata, barbecue e giardino, ideale per famiglie. Residence Chiaro di Luna (voto 92/100) offre piscina, vista mare e monti, con angolo cottura e barbecue, a 8,7 km da Isola di Tavolara. Per chi preferisce il centro, Residence Approdo Verde (voto 82/100) fornisce WiFi gratuito e biciclette a noleggio. Le Tre Querce (voto 89/100) propone villette a schiera con giardino e piscina panoramica ai margini del borgo. Residence Hotel Lu Nibareddu (voto 85/100) si trova a 1 km da Porto Taverna, con due piscine, ristoranti e spiaggia privata.